地埋式城市专业污水处理设备在两相厌氧反应器运行中控制两相分离的方法有：物理化学法和动力学控制法。物理化学法在产酸相反应器中投加产甲烷细菌的选择性抑制剂(如和四氯化碳等)来抑制产甲烷细菌的生长；或者向产酸相反应器中供给一定量的氧气，调整反应器内的氧化还原电λ，利用产甲烷细菌对溶解氧和氧化还原电λ比较敏感的特点来抑制其在产酸相反应器中的生长；或者调整产酸相反应器的pH值在较低水平(如5．5～6．5之间)，利用产甲烷细菌要求中性偏碱的pH值的特点来保证在产酸相反应器中产酸细菌占优势，而产甲烷细菌受到抑制；采用可通透有机酸的选择性半透膜，使得产酸相的末端产物中只有有机酸才能进入后续的产甲烷相反应器，从而实现产酸相和产甲烷相分离。这些方法均是选择性地促进产酸细菌在产酸相反应器中的生长，而在一定程度上抑制产甲烷细菌的生长，或者是选择性地促进产甲烷细菌在产甲烷相反应器中生长，以实现产酸细菌和产甲烷细菌的分离，从而达到相分离的目的。动力学控制法产酸细菌和产甲烷细菌在生长速率上存在着很大的差异，一般来说，地埋式城市专业污水处理设备产酸细菌的生长速率很快，其世代时间较短，一般在10～30min范Χ内；而产甲烷细菌的生长很缓慢，其世代时间相当长，一般在4～6d。