- ¥22491件起订
起订量：
E7103 NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块
- 型号
- E7103
该企业相似产品
自主生化试剂品牌warbio已经入驻多家高校平台，先后入驻南京大学，南京农业大学，东南大学，西湖大学，华南理工大学，北京师范大学，福建农林大学，北京库巴扎，天津基理，上海至采信息采购平台等公司秉持诚信经营，为科研工作者提供更好的产品。专业代理销售国内外生命科学领域的产品以及warbio沃博生物常规生化试剂，公司长期以来与众多国内外厂家和多家专业代理销售公司保持密切联系、沟通与合作，拥有稳定、有效的产品供应渠道。公司长期以来以提供高质量的产品、实惠的价格和优质的服务赢得客户的好评，与多家高等院校、研究所、医院、制药企业等大型科研机构建立长期稳定的合作关系。
主要代理北京庄盟生物分子试剂，Abmart艾比玛特抗体，美国Phytoteche一级代理，美国AATBIO细胞染料，安普未来恒温扩增试剂盒，英国TwistDx公司RPA等温扩增试剂盒，美国GLPBIO抑制剂，Tolobio吐露港生物 ，药物发现一站式平台 陶术生物Topscience等国外生命科学产品试剂耗材。
详细信息
相关产品
NEBNext 酶学转化法甲基化建库相关产品
NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒
NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块
NEBNext Q5U™ 预混液
NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物（双端检索引物）
概述
虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准，但这种转化方式会对DNA 造成损伤，导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq™) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理 DNA (WGBS) 的方法，并结合高效流程化的建库步骤，适用于 Illumina 平台测序。高效的 EM-Seq 酶促转化可ZUIDA程度地减少对DNA的损伤，结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程，最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 和 5-hmC。
优势
的 5-mC 和 5-hmC 检测灵敏度
更高的比对率
更均一的 GC 覆盖度
能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点
更均一的二核苷酸分布
更长的文库插入片段
更高效的建库流程
提供转化模块
产品特点
EM-Seq 能得到更高的文库产量。采用Covaris S2 仪器将 10 ng、50 ng 和 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量，EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量，表明 EM-Seq 显著减少了 WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。
NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 仪器将 50 ng 人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序，片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据，结果如图：EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长，说明：酶学转化法不会对 DNA 造成损伤，而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。
相较于 WGBS，EM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点，并能实现更的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序，使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。
A: CpG 位点检测：通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度，其中每条链都独立计数，最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示：EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。
B: GC 覆盖度：使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度，图中显示不同 GC 含量时 (0-100%)，标准化后覆盖度的分布情况。结果显示：EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性，无 AT 过度测序，也无 GC 测序不足，后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。
相较于 WGBS，EM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng、50 ng 和 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp，同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法，使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库，随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold™ 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000（2 X 100 bases）测序，使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。
图中显示了 EM-Seq 和 WGBS 两种方法在不同起始量，至少 1X 和 8X 测序深度下检测到的DUYOU和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下，CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。
