脱氮除磷反应器(NPR)工艺是用于去除废水中的部分可生物降解COD、磷酸盐和氨氮。COD被生物氧化，形成新的生物量和二氧化碳。加入氧化镁后，与磷酸盐和氨氮形成鸟粪石沉淀。鸟粪石颗粒从水中被去除作为一种肥料用于农业生产。 
Mg2 + + PO3 -4 +NH+4 +H2O→MgNH4 PO4 ·6H2O 
Mg2 + +HPO2 -4 +NH+4 + 6H2O→MgNH4 PO4 ·6H2O +H+ 
Mg2 + +H2PO-4 +NH+4 + 6H2O→MgNH4PO4 ·6H2O + 2H+ 
         NPR反应器从流程上分为预反应区、主反应器和分离区，预反应区主要功能为调节PH值和镁离子的充分混和，在高速搅拌的条件下使加入的氢氧化钠、氧化镁迅速与废水混合，形成细小的MAP絮体。在主反应区中设置曝气系统，一方面在有氧的条件下，部分溶解性COD可能得到降解，另一方面细小的MAP絮体在空气搅拌作用下渐渐长成更大的MAP颗粒，有利于后续的沉淀分离。分离区的主要作用是将形成的MAP颗粒及活性污泥与水进行分离。出水排入后续处理系统，沉淀下来的MAP污泥排出反应器。主反应区由売体、布水系统、曝气系统、分离模块、排泥系统和取样系统组成。