菌检室可分为微生物限度检验室和无菌检查室，是做无菌和微生物检验的洁净操作室。
阳性对照室是用来做菌检用阳性对照菌的接种操作和菌种传代操作的洁净室。

具体一些的区别有：
阳性室要用生物安全柜。微生物限度检验室和无菌检查室用超净台。
阳性室的空调系统要直接排风的，负压。限度室的空调系统可以有回风，相对于外面是正压。

微生物限度检验室简称限度室
无菌检查室简称无菌室