水力自清洗过滤器的工作原理是：污水从进水口通过粗滤网①进入细滤网③后，水中的杂质污物被细滤网③拦截下来并附着在细滤网内壁上，随着杂质污物在细滤网内壁逐渐积聚增多，水通过细滤网的阻力增大并影响到水的流量。当进水端与出水端的压力差（清洗压差）达到预定值时，水力控制器④自动打开排污阀⑤（排污阀与大气相通），系统内的高压水就会顺着吸污管组件②从排污阀⑤排出。此时排污装置的吸污器内会形成一股很强的反向水流，同时此反向压降使得吸污嘴⑨产生一个强劲吸力，从而确保贴靠在细滤网内壁的杂质污物被反向强劲水流冲洗掉，并由吸污嘴⑨迅速吸走排出机外。在强劲吸力排污过程中，设在吸污管组件②上的水力马达⑧靠水的反作用力带动吸污管组件②360°旋转，同时，排污装置尾部的活塞⑥作直线运动，从而使吸污嘴⑨呈螺旋状回转吸吮运动，确保滤网内的每一点都能得到有效清洗。当完成一个清洗排污过程后，正常过滤工作压差得到复原，吸污装置恢复原位，排污阀关闭。继续进入下一个过滤、集污、吸污、排污的工作循环。