质粒DNA的小量制备

实验试剂

1. 溶液Ｉ
50mmol/L葡萄糖
25mmol/L Tris．Cl(pH8.0)
10mmol/LEDTA(pH8.0)
溶液Ｉ可成批配制，每瓶约100ml，在6.895×10⁴Pa高压下蒸气灭菌15分钟，贮存于4℃。

2. 溶液Ⅱ
0.2mol/L NaOH（临用前用10mol/L贮存液现用现稀释)
1%SDS

3. 溶液Ⅲ
5mol/Ｌ乙酸钾 60ml
冰乙酸 11.5ml
水 28.5ml
所配成的溶液对钾是3mol/L，对乙酸根是5mol/L。

4. STET
0.1mol/L NaCL
10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)
1mmol/L EDTA(pH8.0)
5% Triton X-100

5. *溶液
 10mg/ml，用10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)配制。

实验步骤

1. 细菌的收获
  1) 将2ml含相应抗生素的LB加入到容量为15ml 并通气良好（不盖紧)的试管中，然后接入一单菌落，于30℃剧烈振摇下培养过夜。
    2) 将1.5ml培养物倒入微量离心管中，用微量离心机于4℃以12000g离心30秒，将剩余的培养物贮存于4℃。
    3) 吸去培养液，使细菌沉淀尽可能干燥。除去上清的简便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连，轻缓抽吸，并用吸头接触液面。当液体从管中吸出时，尽可能使吸头远离细菌沉淀，然后继续用吸头通过抽真空除去附于管壁的液滴。
2. 碱裂解法
    1) 将细菌沉淀，所得重悬于100μl用冰预冷的溶液Ｉ中，剧烈振荡。须确使细菌沉淀在溶液Ｉ中*分散，将两个微量离心管的管底部互相接触震荡，可使沉淀迅速分散。
    2) 加200μl新配制的溶液Ⅱ。盖紧管口，快速颠倒离心管５次，以混合内容物。应确保离心管的整个内表面均与溶液Ⅱ接触。不要振荡，将离心管放置于冰上。
    3) 加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ，盖紧管口，将管倒置后和地振荡10秒钟溶液Ⅲ在粘稠的细菌裂解物中分散均匀，之后将管置于冰上３-５分钟。
    4) 用微量离心机于4℃12 000g离心5分种，将上清转移到另一离心管中。
    5) 可做可不做：加等量酚：，振荡混匀，用微量离心机于4 ℃以12000g离心２分钟，将上清转移到另一良心管中。有些工作者认为不*酚：进行抽提，然而由于一些未知的原因，省略这一步，往往会得到可耐受限制酶切反应的DNA。
   6) 用2倍休积的乙醇于室温沉淀双链DNA。振荡混合，于室温放置２分钟。
   7) 用微量离心机于4℃以12 000g离心５分钟。
   8) 小心吸去上清液，将离心管倒置于一张纸巾上，以使所有液体流出。再将附于管壁的液滴除尽。除去上清的简便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连，并用吸头接触液面。当液体从管中吸出时，尽量使吸头远离核酸沉淀，然后继续用吸头通过抽真空除去附于管壁的液滴。
   9) 用1ml70%乙醇于4℃洗涤双链DNA沉淀，按步骤H所术方法去掉上清，在空气中使核酸沉淀干燥10分钟。

注：
1. 此法制备的高拷贝数质粒（如Ｘf3或pUC)，其产量一般约为：每毫升原细菌培养物3-5μg。
2．如果要通过限制酶切割反应来分析DNA，可取1μl DNA溶液加到另一含８μl水的微量离心管内，加1μl 10×限制酶缓冲液和１单位所需限制酶，在适宜温育1-2小时。将剩余的DNA贮存于－20℃。
3. 此方法按适当比例放大可适用于100ml细菌培养物：

3. 煮沸裂解

   1) 将细菌沉淀，所得重悬于350μlSTET中。

   2) 加25μl新配制的*溶液，振荡3秒钟以混匀之。如果溶淮中pH低于8.0，*就不能有效发挥作用。
   3) 将离心管放入煮沸的水浴中，时间恰为40秒。
   4) 用微量离心机于室温以12 000g离心10分种。
   5) 用无菌牙签从微量离心管中去除细菌碎片。
   6) 在上清中加入40μl 5mol/L乙酸钠（pH5.2)和420μl异丙醇，振荡混匀，于室温放置5分钟。
   7) 用微量离心机于4℃以12 000g离心5分种，回收核酸沉淀。
   8) 小心吸去上清液，将离心管倒置于一张纸巾上，以使所有液体流出。再将附于管壁的液滴除尽。除去上清的简便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连，轻缓抽吸，并用吸头接触液面。当液体从管中吸出时，尽可能使吸头远离核酸沉淀，然后继续用吸头通过抽真空除去附于管的液滴。
   9) 加1ml 70％乙醇，于4℃以12 000g离心２分钟。
  10) 按步骤H所述再次轻轻地吸去上清，这一步操作要格外小心，因为有时沉淀块贴壁不紧，去除管壁上形成的所有乙醇液滴，打开管口，放于室温直至乙醇挥发殆尽，管内无可见的液体（2-5)分钟。
  11) 用50μl含无DNA酶的胰RNA酶（20μg/ml)的TE(pH8.0)溶解核酸稍加振荡，贮存于-20℃。
注：当从表达内切核酸酶Ａ的大肠杆菌株（endA 株，如HB101 )中小量制粒尤其DNA时，建议舍弃煮沸法。因为煮沸步骤不能*灭活内切核酸酶Ａ，以后在Mg² 存在下温育（V中用限制酶时)质粒DNA可被降解。在上述方案的步骤I之间增加一步，即用酚：进行抽提，可以避免这一问题。