生物法是利用微生物酶来氧化或还原染料分子，破坏其不饱和键及发色基团，从而达到处理目的的一种印染废水处理方法。目前，生物处理法是国内外应用较多的印染废水处理方法。常用的生物处理法主要有好氧法和厌氧法。好氧法常见的有活性污泥法和生物膜法。此外还有AB法、SBR法、AO法、A20法、氧化沟法等。生物膜法又包括生物接触氧化法、生物转盘、生物滤池等。以上各种工艺各有其优点和不足之处，通过对国内70多个印染厂进行调查发现，早期的印染废水处理工程中，活性污泥法的使用*为普遍，由于生物接触氧化法兼有活性污泥法与生物膜法两种处理法的优点，是通过强化充氧及微生物降解作用以提高处理效率，近年来该方法应用广泛。生物转盘法处理效果好，但需大量稀释水而且处理时间长、设备占地面积大。塔式生物滤池法具有负荷高、占地少、不需要专设供氧设备等优点。氧化沟法在国外印染废水处理中用得较多，但池容大，占地面积大。纯氧曝气生物处理在国外应用较多，由于氧转移效率高，混合液污泥浓度MLVSS高，可提高去除有机物及脱色能力。因此，好氧生物处理印染废水的特点是对BOD的去除效果明显，但对色度和COD的去除率不高，尤其如大量的(PVA)等化学浆料、表面活性剂、溶剂及匹布碱减量技术的广泛应用，使COD达到2000～3000mg/L，且BOD与COD的比值由原来的0.4～0.5下降到0.2，单纯的好氧生物处理难度越来越大，此外，好氧法的高运行费用也是一个重要不利因素。为此厌氧生物处理技术开始受到人们的重视。

厌氧法可降解含有偶氮基、蒽醌基、三苯甲烷基的染料废水。近年来，由于难生化降解的新型染料和助剂进入印染废水中，色度增加，其生化性大为降低，因此，如何提高印染废水的可生化性，提高现有印染废水处理技术的效率成为研究的热点。而厌氧生物处理能把难降解的有机物分解成小分子有机物，然后再通过好氧微生物分解成无机小分子物质，因此，厌氧-好氧处理工艺受到人们的重视。随之而来，在传统生化工艺基础上，新的厌氧(水解酸化)-好氧工艺处理印染废水屡有报道，如金一忠等采用水解酸化(A)—好氧(O)-SBR工艺处理印染废水郑祥等采用厌氧生物反应器与好氧MER组合工艺处理毛纺印染废水，洪俊明等采用A/O-MER组合工艺处理活性染料废水，肖文胜等采用水解酸化-曝气生物滤池处理印染废水试验研究，李茵等采用兼氧-好氧工艺处理染料废水的研究，刘帅霞等兼氧酸化水解-好氧生物处理纺织印染废水生产性研究，骆丽君采用水解-好氧-混凝气浮工艺处理印染废水，鲁秀国等采用水解酸化-好氧氧化-化学氧化-吸附工艺处理印染废水，付永胜等人采用的水解酸化-UASB-SBR组合法处理印染废水、刘帅霞等人采用的水解酸化-生物接触氧化工艺处理印染废水、肖利等人采用的缺氧-好氧-压滤-富氧生物炭处理印染废水等，都取得满意的效果。厌氧生物滤池(AF)近年来也出现了一些变型，如厌氧污泥床—滤层反应R1器、变速厌氧—缺氧生物滤池等。AF的优点是运行稳定、启动快、反应器内污泥产率低。但是AF的性能高、价格低的新型填料尚待开发。

总的来说，生物法处理印染废水的不足之处在于，微生物对营养物质、pH、温度等条件有一定的要求，难以适应印染废水水质波动大、染料种类多、毒性高的特点，同时还存在占地面积大、管理复杂、脱色效果不佳，COD去除率低等缺点，并且，随着废水排放标准的提高，要求出水有机物的浓度越来越低，而在较低有机物浓度的环境中，微生物因缺乏营养物质而难以生存，因此，生物法必须与其它方法进行组合才能取得令人满意的效果。