1）显微成像：可人工控制显微图片的观察、拍摄、存储并连续自动等间隔拍摄多达200张图片。★具有实时预览饱和警告、自动背景矫正特性。
2）★中文、拉丁文双语显示的藻类专家图库（共15个门、1647个属、14831个种），已有藻类有效图库量18.3756万张以上，各图库属种和内容可自行扩充。
3）★藻类智能鉴定：具有有效地按图像形状、颜色、纹理等相似度来自动比对藻类图像的智能式【以图搜图】特性。以及通过形态学搜索、模糊关键词搜索、常见藻搜索、分类学搜索，经图像、文字对比，快速鉴定藻类。能自动索引藻类的用户计数表成所在流域小图库，使【以图搜图】更快捷。
4）★藻类计数及形态测量功能：a、浮游生物分类标记：采用不同颜色、不同大小的色圈标记各种浮游生物，并对200张所拍摄图片内的各种浮游生物，按类点击、自动累积计数（可合并不同倍率计数结果、多个样品计数结果）；b、优势种自动排序、按门（类）排序、优势群落组成百分比分析；c、可自动计算香农-威纳指数、均匀性指数、藻密度自动换算、浮游动物丰度自动换算；d、按大量形状模型来辅助计算浮游生物的生物量（内置34种几何模型，通过测量少量参数即可计算个体/细胞体积）。内置常见淡水藻、常见海洋藻等计数表，并可自行编辑、导出、导入计数表。可按视野面积、藻群体面积、浮游动物个体面积测量，按细胞直径、藻丝、鞭毛长度、浮游动物体长及触角测量，以及按枝角分枝角度测量等。
5）★微囊藻分析模块能自动学习与自动分析团状微囊藻群体的细胞数，并可自动计数颗粒性或单细胞微藻、链状微藻细胞、线虫等类的浮游动物。
6）★的景深扩展的多聚焦融合3D高清晰成像。多视野图像的自动拼接、剪裁编辑修正特性。有藻类的颜色、形状自动学习分类特性，可监视修正转换藻类类别，并二次学习和保存分类特征。
7）具有浮游生物细胞的自动抠图特性，可快速提取其主边缘特征图像。具有对模糊、重叠的浮游生物图像的清晰化处理特性。
8）分析软件具有在线自主升级的特性。