NiV可以感染各个年龄段的猪。马来西亚的疫情显示不同类别的猪表现出不同的临床症状，例如母猪首先表现为神经症状，而肉用猪表现为呼吸道症状，此外，圈养的母猪和公猪活动受到限制，有可能掩盖了其呼吸道症状。

感染后的断奶仔猪和肉用猪表现为急性发热症状，并伴有程度不同的呼吸道症状。患病严重的猪的鼻孔流出带有血丝的黏液。同时可观察到神经症状，包括颤抖、抽搐、肌肉痉挛、后肢无力及程度不同的跛行和痉挛性局部麻痹。

感染后的母猪和公猪表现为急性死亡或急性发热症状，并伴有呼吸困难（气喘），唾液分泌增多，从鼻孔流出带有血丝和脓性分泌物的黏液。神经症状包括兴奋、头颈僵直、破伤风样痉挛、四肢前伸、眼球震颤、空嚼、明显的咽部肌肉麻痹。曾有报道NiV可导致母猪流产。

哺乳仔猪的死亡率大约为40％，哺乳仔猪感染造成的死亡以及母猪不能哺乳造成仔猪死亡各自所占的比例尚不清楚。外表健康但血清学证实为阳性的母猪仍可哺乳出健康的小猪。绝大多数感染的小猪表现张口呼吸、后肢无力并伴有肌肉震颤以及神经性抽搐等症状。

在一个场中，临床发病的猪只占很少数，大部分的猪不表现任何的临床症状。该病的潜伏期估计为7-14天，猪可以经消化道和其他途径感染NiV。此病在猪群内传播迅速，感染后10-14天可以测到中和抗体。

人、猫、狗和马也可以感染NiV。人感染NiV后，多数以神经症状为主，也可以呼吸道症状为主，死亡率很高；狗感染NiV后，可出现类似犬瘟热症状；猫感染NiV后，死亡率很高；马感染NiV后可以出现神经症状，但是死亡率似乎较低。所以在临床诊断时，应注意感染的猪场及其周围人和其他动物的发病情况，注意发病猪场新近是否引进新猪。

死后剖检发现NiV感染猪没有相对特殊的病变，肺和脑膜是主要的病变器官。大多数病例表现由轻微到严重的肺部病变，包括程度不同的实变、气肿、淤血性溢血以及呼吸道有带血丝的分泌物，切开肺部，可见肺小叶间隔肿胀。脑膜弥漫性充血、水肿，其他的内脏器官没有明显的变化。