破坏ipRGCs功能会导致昼夜生物钟功能丧失，使瞳孔对光反应混乱。ipRGCs并非都一样，负责身体周期节律的细胞和瞳孔光反应的细胞，是截然不同的两种，每种只负责一项任务。根据它们表达Brn3b转录因子的方式不同，一种称为Brn3b-negative M1 ipRGCs，能刺激下丘脑的视交叉上核（SCN）；另一种称为Brn3b-positive ipRGCs，刺激余下的相关脑区标靶，包括橄榄顶盖前核。它们在形态和电刺激反应上虽然相似，但会刺激不同的脑区，执行不同的光控功能。只破坏Brn3b-positive ipRGCs会严重打乱瞳孔光反应，却不会损害日节律光协同作用（昼夜生物钟节律）。

“从生物学角度来讲，你不能总是相信自己所看到的，必须深入研究才能发现真相。我们的研究显示，两种结构相似的视觉神经细胞截然不同，对视觉功能的影响也不同。” 霍普金斯大学克里格文理学院生物学系萨莫·哈特解释说，“光照会影响人们的很多生理功能，包括睡眠和情绪。我们在研究光照对人体细胞、分子和行为方式的影响，而这种影响和我们看的方式、看到的是什么无关。”临床医生常用检查瞳孔对光的反应性来诊断病人有没有睡眠问题，而现在我们知道，控制瞳孔光反应的神经细胞和控制睡眠周期神经细胞不是同一种。尽管这种方法大部分时候还管用，但瞳孔光反应混乱的人也可能有正常的睡眠周期，反之亦然。