医院污水来源及成分比一般生活污水排放情况复杂很多，同工业废水一样非常难以处理。医院废水中含有各种各样病原微生物，并含有大量的传染性病菌，如果不经医院污水处理设备有效处理就随意排放，就会成为扩散疾病的重要途径，且污染环境较为严重，严禁将医院的污水和污物随意弃置排入下水道，保护生态安全。
    医院污水处理设备的流程工艺如下：
    我们都知道医院所产生的污水中含有各类的消毒剂、药剂、试剂等多种化学物质。比如结核病类医院所产生的污水，每升可检验出结核杆菌几十万至几百万个。因此医院废水具有空间污染、急性传染和潜伏性传染等特征。
    1.不同性质的医院所产生的废水性质有很大的不同，肝炎等类型的传染病类病房或传染类医院所排放出来的医疗废水，必须采用二级处理，并需要进行预消毒处理以后才可以排放。
    2.处理出水排入自然水体的县及县以上医院，必须采用一级沉淀消毒处理和二级生化消毒工艺处理，当采用一级消毒处理流程时，医院污水应与医务工作人员及生活区污水、雨水分流。
    3.处理出水排入城市下水道(下游设有二级污水处理厂)的综合医院需要采用二级处理，对采用一级处理工艺的必须加强处理效果。
    4.对于经济不发达地区的小型综合医院，条件不具备时可采用简易生化处理作为过渡处理措施，之后逐步实现二级处理或加强处理效果的一级处理。