大水、微生物和氧存在的条件下，利用微生物的代谢作用氧化分解发臭物质，以达到净化气体的目的。生物处理大致可以分为3个过程。1、恶臭气体被填料载体(固有微生物)吸附;2、恶臭气体向微生物表面扩散、被微生物吸附;3、微生物将恶臭气体生物降解。不含氮的恶臭物质被分解成CO和H₂O，含硫恶臭物质被分解成S,SO₃²⁻，SO₄²⁻，含氮恶臭物质则被分解成NH₄⁺,NO₂⁻,NO₃⁻。