在制药过程中常常需要生物、物理和化学工艺的综合。因此在制药生产工艺和废水组成都十分复杂。制药行业废水主要污染物有悬浮物（SS）、化学需氧量（COD）、生化需氧量（BOD）、氨氮及挥发酚等有毒有害物质。制药废水中难降解有机物浓度高；废水水量、水质变化幅度大、规律性差；废水中含有抗生素药物和大量胶体物质，ph变化大，带有颜色和气味。就需要制药污水处理设备来进行处理。

制药污水处理设备常用处理方法;
抗生素废水处理方法与一般工业废水处理法类似，主要有物化处理方法、生化处理方法以及多种方法的组合生化处理等。
物化法：
混凝沉淀法、吸附法、光催化氧化法等。
生物法：
利用微生物的代谢作用去除废水中有机污染物。根据文生物的代谢种类分为厌氧型和好氧型两种方法。
具体方法有：活性污泥法、生物膜法、氧化塘法和污泥消化等。
对于好氧生物处理来说，抗生素工业废水是高浓度有机废水，处理时需对原废液进行大量稀释，清水、动力消耗很大，成本较高，实际废水处理率也较低。
MBR工艺处理：
1、能去除废水中的有机物，对废水处理效果高，随着运动时间的延长，活性污泥在膜表面不断累积、压缩，形成密实的滤饼层以及凝胶层对水中的可溶性分子有良好的降解作用。
2、与传统生化法相比还可省去二沉池，减少了工程的占地面积，污泥排放量少，运行费用低且自动化程度高。
3、集水处理的膜法和污水处理的活性污泥法两种技术与一体，兼具过滤机理和生化作用两大特点，从而保证出水水质稳定。