总有机碳分析仪的工作过程：

作为载气用的空气由泵抽入，经过滤器过滤，用调压阀控制压力，进入位于高温炉（温度控制在８００－９００）中的净化管，在此，空气中的有机物燃烧，变成了水和二氧化碳，再经装有碱石灰（用生石灰同氢氧化钠溶液作用后，在２００－２５０℃下干燥而成）的吸附筒，水和二氧化碳被吸收掉，得到的将是十分纯净和干燥的空气。

然后把这种空气分为两路，一路进入红外线气体分析器的参比室，作为不含有二氧化碳的零点气体，即参比气体，再进入低温炉（约１５０　℃），它又作为无机碳燃烧用的助燃气和载气，在此燃烧结果生成二氧化碳和水，经脱水器除去水分，二氧化碳由切换阀进入红外线气体分析器的测量室，测定浓度

另一路进入位于高温炉中的石英制燃烧管二氧化碳由切换阀进入位于高温炉中的石英制燃烧管，其内填充有催化剂（Ｃｒ２Ｏ３），在此，被测废水中的总Ｃ和变成二氧化碳和水，经脱水器除去水分后，产物由切换阀导入红外线气体分析器的测量室，测定生成的二氧化碳浓度。