由于我国餐厨垃圾还处于管理前期，餐厨垃圾资源化获得的收益远远小于投入，目前国家以补贴形式承担餐厨垃圾规范化收运及处理的成本差额，由国家分别支付给收运单位和处理单位。由于国内尚没有完善的餐厨垃圾管理流程，餐厨垃圾补贴费用核算基本参照已有的数值，并没有科学设计管理流程，餐厨垃圾管理、收集及监管效率低下。总而言之，目前国内大多数餐厨垃圾的无害化处理尚处于起步阶段，面临的主要问题有如下几点。

一、关于餐厨垃圾管理的法律法规不健全

虽然在国家层面的《中华人民共和国固体废弃物污染防治法》和《中华人民共和国循环经济促进法》等法律涉及对餐厨垃圾的管理，但这些法律的规定都过于原则化，操作性不强。从目前我国社会的发展现状来看，经济发展迅速，人们外出就餐频率增加，餐厨垃圾产生量只增不减，为了美化城市环境，避免成为垃圾围城，在国家层面上将餐厨垃圾统一立法显得尤为必要。国家应该制定餐厨垃圾管理的具体细则，包括将餐厨垃圾的概念进行统一，对餐厨垃圾分类回收的主体、方式做出明确规定，违反餐厨垃圾管理行为的惩罚标准做出规定。由于各地饮食习惯的差异，导致餐厨垃圾在成分含量有所不同，所以，各个地区需因地制宜根据具体情况制定相应的法规

二、在餐厨垃圾管理方面机关单位职责未全面履行

各部门职责不明确在对餐厨垃圾的管理中，机关单位起的主导作用不明显以及职责不明确是造成餐厨垃圾堆积成山局面的原因之一。餐厨垃圾的有效处理与居民的居住环境和经济的健康发展息息相关。治理餐厨垃圾是一项迫在眉睫的工作。餐厨垃圾的管理是一项系统工程，它的管理是从产生、运输、回收、处理等多个环节，这其中会涉及环保部门、工商部门、卫生部门的责任，多个部门监管不同环节，它需要工商、环保质监等多个部门的协调配合，这其中容易造成职权交叉、权利冲突的现象。这样会使得工作部门工作效率低下，使餐厨垃圾监管的目标难以实现。

三、餐厨垃圾管理制度不健全

餐厨垃圾分类回收是实现餐厨垃圾资源化的前提，餐厨垃圾可以分为废弃油脂和厨余垃圾，二者在源头、成分、处置方式上存在明显差别，所以对餐厨垃圾分类回收十分必要。但是由于目前我国对餐厨垃圾的管理尚未形成一个完整的体系，餐厨垃圾分类回收面临很多障碍，在《固体废弃物污染防治法》和《中国21世纪议程》中都提到要求垃圾分类的问题，但都过于原则化，操作性差。对于餐厨垃圾分类回收的实施细则还比较少。餐厨垃圾分类的奖惩规定上还存在不足，在发达国家，对积极将餐厨垃圾分类的个人及单位实行奖助制度，而对没有将餐厨垃圾分类的单位或个人实行严厉的惩罚制度。而在我国尚未形成这种鲜明的奖惩力度，这也是餐厨垃圾难以实现分类回收的原因之一。此外，公民的环境保护意识比较淡薄也是餐厨垃圾难以分类回收的重要原因。我国尚没有形成餐厨垃圾是一种有用资源的认识，大多数人会将餐厨垃圾与生活垃圾一起扔进垃圾箱。另外对私自卖出餐厨垃圾的行为惩罚较轻，而且餐饮企业可以获得可观利益，受利益的驱使，使得餐厨垃圾落入不法商贩手中，导致一些餐厨垃圾处理厂因无法收集到餐厨垃圾而面临停业状态。