生物强化技术是属于一种新型的生物技术，并且应用治理水污染的效果比较明显，在应用废水污染治理的过程中，其原理为可以通过对相应具有特殊功能菌种的配置，在这些特殊的菌种中，具备被强化的新陈代谢的能力，在投放于水源当中，可以运用微生物本身的新陈代谢的能力，对污水中污染分子进行分解，同时对于具有污染性质的有机物来说，可以转化为无污染的无机物从而可以实现污水的净化。在应用生物强化技术对水污染进行治理的过程中，主要的作用包括了以下几个方面：

1.直接作用：对于污染水体中的污染源来说，水体当中的有机物分子可以进行直接的处理降解，从而可以对水质进行净化，降低水污染的程度。

2.基因水平转移作用：在应用生物强化技术的过程中，可以对具有特定代谢基因的微生物与自然基因的代谢途径进行交换，这样在基因水平中，可以实现转移交换的作用，一定程度上提高生物体降低水污染的有效性。

3.共同代谢作用：在应用生物强化技术的过程中，通过运用微生物的新陈代谢作用，可以采取共同代谢的方式，对污染中的污染结构进行改变，充分发挥生物强化技术降解治理污水的作用。