通常消毒设备的安装位置应选择离动力水源近，且操作比较方便的位置。安装时应注意留出一定的检修空间，设备后大于0.6 米，以方便维护。对于出厂时已装好的部件，开箱后应重新检查，对于松动的部件要重新紧固。将抽料软管同原料罐进行连接。水射器同设备出气口的连接用硬PVC 管连接。设备进气管应接到室外通风处，一定要保持空气畅通，可在入口增加防护措施。
水射器一般应固定在设备后面，高度应与发生器消毒液出口一致或低于发生器消毒液出口。水射器可水平安装或垂直安装。水射器前要装一个电接点压力表和调节阀门。注意：电接点压力表应安装在水射器的前端，调节阀门的后边。投加管道应使用PVC 给水管，管径应按设备的使用要求配备，特殊情况需现场确定。尽量减少投加管路的阻力降，如：弯头、高差等。