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一、动物实验 - 蛋白质组学服务项目介绍
蛋白质组学(Proteomics) 一词,源于蛋白质(Protein) 与 基因组学(Genomics) 两个词的组合,是大规模、高通量地研究一个细胞、组织或物种中表达的全套蛋白质的学科。基于近年来质谱技术的普及和发展,蛋白质组学已经成为蛋白质研究领域的重要部分。蛋白质组学技术可以对生物样本中蛋白质进行大规模鉴定和定量,进而从高通量数据中挖掘有用信息,为研究提供线索和方向。
目前蛋白质组学领域zuichengshu的即为niaoqiang法(shotgun),即从样品中提取蛋白质,经过还原、烷基化、酶解等步骤变为肽段混合物,再经过电喷雾进入质谱中扫描,得到质谱图,通过软件和数据库进行解析,得到相应的蛋白质信息。
主要设备:质谱仪 Thermo Q Exactive / AB Secix 5600+
二、动物实验 - 蛋白质组学服务应用
蛋白质组学是在大规模水平上研究蛋白质的特征,如表达水平,蛋白间互作,翻译后修饰,从而发现不同发育、生长期和不同生理、病理条件下的特点,在基础医学和疾病机理研究中有着重要作用。
三、样品保存运输
1、胶点/胶条样本
①蛋白量大于100ng,4℃保存,冰袋运输。
②收集时,用双蒸水对胶块进行清洗,采用干净刀片将目的条带区域(避免带入空白或非目的区域)切下,装入EP管中保存。
③考染胶条,需要条带肉眼清晰可见,银染胶条不建议进行蛋白质鉴定(银染需质谱兼容试剂盒银染)。
④不同条带不建议混合处理,避免干扰。
⑤提供样本时需提供胶块考染图和样品取点图。
2、蛋白溶液样本
①蛋白质鉴定所需蛋白量至少大于10ug,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②定量蛋白质组学所需蛋白量大于100ug,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
③修饰蛋白质组学所欲蛋白量大于5mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
④建议测定蛋白浓度后,液氮速冻,避免蛋白降解,另外需要告知蛋白溶液的缓冲液成分和浓度,方便实验室收到后进行后续处理。
⑤样本若为IP实验后磁珠-抗体-蛋白复合物,注意不要加入loading buffer,应采用wash buffer清洗后,离心去掉上清,重复三次,再使用PBS冲洗磁珠三次,去上清,收集磁珠沉淀。
3、细胞样本
①细胞量1x107个,收集细胞沉淀,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。
4、血清样本
①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免溶血。
5、血浆样本
①样本量500uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免溶血。
6、尿液样本
①样本量2mL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样品应尽量避免带入粪便残渣。
7、动物组织样本
①样本量300mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面血液,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
③固定液浸泡过的样本无法进行检测。
8、植物组织样本
①样本量500mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面泥沙,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
③固定液浸泡过的样本无法进行检测。
9、微生物样本
①样本量干重200mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。
四、结果展示
五、价格列表