潜水搅拌机在不同的除污环境有不同的安装方式，具体的如下：
a.卧式安装：
卧式安装是指潜水搅拌机水平安装，即其机轴与潜水搅拌机的重力方向相垂直。卧式安装一般是安装在水池边壁或池角附近，这样受周围安装条件的限制比较小，对池壁等土建结构影响小。
b.悬臂安装：
对于质量轻的小型潜水搅拌机可安装在悬臂梁上，可将此梁简单地夹在或栓接在水池边，悬臂导杆长度不超过3m。
c.地面安装（移动安装）
地面安装又称底座安装或抛锚式安装，即潜水搅拌机固定安装在一个底座上，利用潜水搅拌机底座沉入池底安装使用，常用于较浅的水池或池塘中。
d.导杆安装
潜水搅拌机的工作位置可沿导杆上升或下降，以此调整潜水深度；潜水搅拌机还能在导杆上旋转，调整安装角度，以调节从潜水搅拌机叶轮冲出的射流方位以达到效果。导杆安装系统根据功能又分为单导杆和双导杆系统。