在分子筛的工作过程中，‌其高比表面积和规则的孔道结构允许它通过选择性吸附来分离不同的分子。‌分子筛的选择性吸附基于分子的大小和形状，‌能够捕获特定分子并将其分离。‌例如，‌在医用氧机中，‌分子筛通过吸附水分子去除氧气中的水分，‌通过吸附碳氢化合物去除氧气中的有害物质，‌以及通过吸附二氧化碳和氮气来提高氧气的纯度和质量。‌这种选择性吸附的过程使得分子筛在气体分离和提纯领域具有广泛的应用。‌
 

　　分子筛孔隙率非常高，内表面积很大，内空穴占体积的50%左右。分子筛吸附剂吸附性能的决定因素是其本身的结构，此外不同硅铝比、不同平衡阳离子、不同孔和孔道结构以及分子筛的成型、活化等都会影响分子筛吸附剂的吸附性能。其吸附作用主要表现在两点：按分子的几何尺寸、形状选择吸附和按分子的极性、不饱和度及极化率选择吸附。