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一、 用途:
RhizoView是一款用于洗根后的专业根系分析系统,可以分析根系长度、直径、面积、体积、根尖记数等,功能强大,操作简单,软件可分析植物根系的形态,色彩、分级伸展分析及根系的整体结构分布等等。广泛应用于根系形态和构造研究。
二、 原理:
RhizoView洗根测量系统可以通过扫描和摄像两种方式获取高分辨率植物根系彩色图像或黑白图像,针对获取的图像,利用插入解密的专业根系分析软件读取TIFF,JPEG标准格式的图像,同时配合针对图像获取系统配置的校准文件,对获得的高质量根系图像进行分析。
采用非统计学方法测量计算出交叉重叠部分根系长度、直径、面积、体积、根尖等基本的形态学参数;利用软件的色彩等级分析功能,还可以对根系颜色进行分析,从而进行根系存活数量、根系生长和营养状况等方面研究;
利用软件的高级分析功能,还可以对完整的植物根系图像进行根系连接分析(研究根系分支角度、连通性等形态特征)、根系拓扑分析(研究根系连接数量、路径长度)和根系分级伸展分析(记录根系整体等级分布情况)。从而满足研究者针对植物根系不同类别和层次的研究。
三、 组成:
1、 图像获取系统:
Ø 根系扫描系统:在扫描面板下方和上盖中安装有专业的双光源照明系统,并且在扫面板上预留了双光源校准区域。此外,还配备有专用、高透明度根系放置盘。扫描时,扫面板下的光源和上盖板中的光源同时扫过高透明度根盘中的根系样品,这样可以避免根系扫描时容易产生的阴影和不均匀等现象的影响,有效地保证了获取的图像质量。
Ø 根系摄像系统:高速高拍,可做裁减,旋转,放大等处理,比扫描方式快。达到300-600的DPI分辨率。
2、 根系分析系统:基本版 /标准版 /专业版/拟南芥版分析软件
3、 说明书
4、 电脑 (用户自备)
扫描系统类型及区别见下表:
技术参数 | RhizoView扫描仪(A4尺寸) | RhizoView扫描仪(A3尺寸) |
描述 | 高质量高速扫描仪 | 多功能、高速的扫描面积大的扫描仪 |
可否在野外使用 | N | N |
是否需要电脑操作 | Y | Y |
光学分辨率 | 4800×9600dpi | 4800×9600dpi |
扫描速度 | <6秒 | <6秒 |
扫描面积cm | 反射稿:215.9×355.6mm | 反射稿:304.8×431.8mm |
输出格式 | JPEG,TIFF,PDF,BMP等 | TIF,BMP,EPS,JPG,PSD,PDF,SCT |
色彩位数 | 彩色:48位,灰阶:16位 | 彩色:48位,灰阶:16位 |
供电 | 100-240V(±10%),50/60Hz | 100-240V(±10%),50/60Hz |
摄像系统:
光学元件:2000万高清CMOS镜头
摄像面积:A3幅面
摄像速度:仅需1s
图像色彩:24位彩色
图像格式:JPG、TIFF、BMP、PDF
对焦方式:自动对焦
接口类型:USB2.0电脑接口,即插即用
供电:100-240V(±10%),50/60Hz
四、 根系分析软件技术指标:
测量参数 | WinRHIZO软件版本 | |||
整体参数 | 基本版 | 标准版 | 专业版 | 拟南芥版* |
总长 | Yes | Yes | Yes | Yes |
平均直径 | Yes | Yes | Yes | Yes |
总面积 | Yes | Yes | Yes | Yes |
总体积 | Yes | Yes | Yes | Yes |
根尖、分叉和交叠计数 | Yes | Yes | Yes | Yes |
根直径等级分布参数 | ||||
长度 | No | Yes | Yes | Yes |
面积 | No | Yes | Yes | Yes |
体积 | No | Yes | Yes | Yes |
根尖计数 | No | Yes | Yes | Yes |
其他功能 | ||||
可以选择用户定义的矩形区域进行分析或从中排除 | Yes | Yes | Yes | Yes |
可以选择用户定义的圆形和不规则形状区域进行分析或从中排除 | Yes | Yes | Yes | |
图像编辑以去除伪影或图像缺陷。 您可以选择和编辑图像中存在的任何颜色或定义您自己的颜色。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
交互式或批量(无操作员监督)分析。 注意:并非所有分析都可以批量完成。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
可以打印带有或不带有分析标记的图像并将其保存到文件中。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
在某些情况下,可以从分析中去除碎片。 当它们不与根接触时,可以根据它们的面积(任何小于指面积的东西都被视为碎片)或它们的长宽比(碎片往往是圆形的,而根被拉长)过滤掉它们。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
碎片也可以根据它们的颜色过滤掉。 | Yes | Yes | ||
附带有大量插图的印刷版和 pdf 彩色手册。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
专业版还具备如下功能特征:
1、根系颜色分析:根的长度、面积、体积、根尖计数、根系存活数量等研究
(对根系或者根系附着菌种颜色进行分类,如健康根、浅程度受害根、重程度受害根等,软件可计算每种颜色根系的总长、总表面积、总体积、总根尖数量;每种颜色根系的平均长度、平均表面积、平均直径等)
2、根系连接(link)分析:用于根系分支角度、连通性等形态研究
(与拓扑和发育分析的区别是,link分析可以针对非完整根系!软件给出的结果有分析对象的根系平均直径、平均长度、平均表面积、每个分叉角度的平均值;分叉的总数量;每个分叉的长度、表面积、平均直径、角度、级别等)
3、根系拓扑(Topology)分析:连接数量、外部路径长度、高度、幅度、路径长度、结构化连接等研究(需要根系完整)
(必须是要完整的根系扫描图像。软件可计算主根的长度、所有次级根的总长度、平均长度、平均直径、平均表面积;每一级分叉的下级总分叉数量;每一级分叉的总数量等)
4、根系发育(Development)分析:记录根系整体等级分布情况(需要根系完整)
(必须是要完整的根系扫描图像。是拓扑分析的延伸分析。软件可计算每一个分级根系总长、总表面积,平均长度、平均直径、平均表面积、分级数量和分级顺序等)
* 拟南芥版具有专业版所有功能,另外还可针对拟南芥类植物的细小、交叉根系进行测量
五、 产地:中国