有机肥发酵车间臭气净化设备工艺选择有化学吸收法、吸附法、生物法、UV光氧净化可供选择。
有机肥发酵车间臭气净化设备—化学吸收法：
主要是采用液相介质净化气体处理的工艺，通过液体与气体的直接接触，对净化气体中的质进行吸收。设备结构简单，运行能耗，操作方便，维护简便。是一种被广泛应用于恶臭控制，非常成熟、稳定，有效的工艺方法。该工艺适合于处理量，中浓度的恶臭气流，处理效果取决于恶臭气体在化学溶液中的溶解度和与化学溶液的反应速度。
有机肥发酵车间臭气净化设备—吸附法：
该方法是当质通过装有吸附剂（如活性炭、疏水分子筛等）的吸附塔时，利用该吸附剂对的强吸附力，将质吸附下来，从而达到净化废气的目的。该方法设备简单，去除效果好，多用于净化工艺的末级处理。但该方法也存在对浓度废气处理效率、占地面积大、气阻大、吸附剂需经常换或再生等缺点，是吸附剂脱附后的气体难于收集而又排回中，是一种不的途径。不易处理废气中有粘性、固态颗粒的废气，吸附剂会被堵塞。
有机肥发酵车间臭气净化设备—生物法：
目前应用较多的生物法主要为生物过滤法。生物过滤法处理过程是由天然滤料来吸附和吸收恶臭气流中的臭气，然后由生长在滤料中的细菌和其它微生物来氧化降解。通常情况下，这些天然滤料上本身固有的细菌和其它微生物就足以用来除去臭气。生物过滤法主要有两种布置方式，生物过滤池（可在地面以上和以下）和生物过滤塔。生物过滤是使收集到的废气在适宜的条件下通过长满微生物的固体载体(填料)，气味物质先被填料吸收，然后被填料上的微生物氧化分解，完成废气的除臭过程。
固体载体上生长的微生物承担了物质转换的任务，因为微生物生长需要足够的有机养分，所以固体载体具有的有机成分。要使微生物保持的活性，还为之创造一个好的生存条件，如：适宜的湿度、pH值、氧气含量、温度和营养成分等。