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叶绿素（Chlorophyll）是植物光合作用中的重要光合色素，可分为a、b、c、d四类。叶绿素不溶于水，而溶于有机溶剂，如乙醇、丙酮、、氯仿等；叶绿素不很稳定，光、酸、碱、氧、氧化剂等都会使其分解；叶绿素a分子式为C55H72O5N4Mg，酸性条件下，叶绿素a分子很容易失去卟啉环中的镁成为脱镁叶绿素；叶绿素a存在于所有的浮游植物中，大约占有机干重的1%～2%。
叶绿素a本身对环境没有危害，但它是估算浮游植物生物量的重要指标，可以通过测定水中浮游植物叶绿素a的含量，掌握水体的初级生产力情况和富营养化水平，在环境监测中，叶绿素a含量是评价水体富营养化的指标之一。
叶绿素a的分子结构由4个吡咯环通过4个甲烯基（=CH—）连接形成环状结构，称为卟啉（环上有侧链）。卟啉环结合着1个镁原子，并有一环戊酮（Ⅴ），在环Ⅳ上的丙酸被叶绿醇（C20H39OH，分子量893）酯化、皂化后形成钾盐具水溶性。

在酸性环境中，卟啉环中的镁可被H取代，称为去镁叶绿素，呈褐色，当用铜或锌取代H，其颜色又变为绿色，此种色素稳定，在光下不褪色，也不为酸所破坏，浸制植物标本的保存，就是利用此特性。
在光合作用中，绝大部分叶绿素的作用是吸收及传递光能，仅极少数叶绿素a分子起转换光能的作用。它们在活体中大概都是与蛋白质结合在一起，存在于类囊体膜上。
叶绿素a的量越多，说明水体富营养化越严重。当叶绿素a的含量大于10微克每升则说明水体已富营养化。水体富营养化一般采用的指标是：氮含量超过0.0.3 mg/L ,磷含量大于0.01～0.02mg/L ,BOD大于10 mg/L ,pH值7～9的淡水中细菌总数超过10万个／毫升，叶绿素a含量大于10 ug/L。当叶绿素a的含量大于10微克每升则说明水体已富营养化，近年来对其检测的标准也在不断完善。
水中叶绿素a的测定
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