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琼脂糖凝胶电泳比较法：
若DNA样品中含RNA或其它杂质，凝胶电泳是一种方便而较准确的定量方法。
1. 取2μlDNA样品，加0.4μl电泳上样缓冲液（含溴酚蓝），混匀后加样于含0.5μg/ml溴乙锭的琼脂糖微型电泳凝胶的孔格内。
2. 取一系列浓度不同的2μl标准DNA样品（0.5～50μg/ml）0.4μl上样缓冲液混合上样。标准DNA溶液中，应含有一种与样品DNA分子量大小相近似的DNA分子。
3. 电泳：使DNA移入琼脂糖胶内。一般为溴酚蓝迁移2cm左右。
4. 将凝胶浸入含0.01mol/L MgCl2的电泳缓冲液中5分钟，进行背景脱色。
5. 在短波紫外线（254nm）下进行拍照，比较样品DNA与DNA的标准品的荧光强度，并计算出待测样品中DNA浓度。
荧光法灵敏快速。但它的荧光强度决定于溴乙锭嵌入碱基中的多少，这与DNA的超螺旋程度密切相关，标准与样品难以*一致，并且还受其它影响荧光发光污染物的影响。
注：本文琼脂糖凝胶电泳法核酸定量分析属于分子生物技术文章，主要介绍核酸、定量分析方面的知识，内容仅供学习交流与参考。