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大麦基因组测序的新里程碑

时间:2015-08-28      阅读:173

    大麦是一种被广泛种植的谷物,通常用来制造啤酒和其他酒精性饮料,具有一个大而高度重复的基因组,很难*测序。目前,由美国加州大学里弗赛德分校(UCR)的科学家带领的一个团队,从2000年开始进行的大麦基因组测序工作,达到了一个新的里程碑。研究人员对基因组中的绝大部分序列进行了测序,总共含有近三分之二的大麦基因。

    其研究不仅将扩大遗传学家对于大麦DNA的知识面,也有助于我们在基因水平上理解小麦和其他食物来源。它还可以应用于植物育种,增加某些特性(如麦芽品质或杆锈)标记的度。研究人员:“我们现在对大麦基因组中的遗传信息有了更高的分辨率。这是世界各地使用的一种改良资源。在这项工作之前,一个*持有的观点是,基因在大麦、小麦及其近缘种基因组中的分布是这样的,基因密集区域只是在染色体的末端附近,那里也有一个很高的重组率。我们的工作揭示了明确的例外,确定了基因丰富、但低重组的不正常地区。”

    重组指的是,在减数分裂过程中自然形成新的基因组合,这是细胞周期中的一个阶段,在这个阶段染色体配对并进行交换。Close解释说,植物育种者依赖于减数分裂重组,把麦芽品质、杆锈或许多性状相关基因的有利形式,引入到栽培品种中。杂交并对后代植物进行了筛选,寻找理想的新特性组合。当一个基因的有利形式(等位基因)位于一个基因密集低重组区域时,需要开展更多的工作,将有利的等位基因引入现有的品种,而不会牵涉邻近的基因——可能存在于不良的形式。

    研究人员说:“例如,育种者可能成功地加入了一个来自于野生大麦的、有利于茎锈病的、良好的等位基因,但随着这个基因转移的还有另一个基因,从而导致成熟麦穗的脱落。现在,育种学家将会得到一种茎锈病抗性的植物,但是在收获之前,种子都掉到地上,而不是留在植物上。所以,如果一个基因位于一个基因密集的重组区域,那么这就意味着,杂交后必须对更大数量的后代进行检测,以寻找那些来自罕见重组事件的后代,将所需的新等位基因与邻近基因的不良形态分离开来。了解基因密集的低重组区域的位置,有助于决定哪些基因有助于品种改良。”

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