根据《建设项目竣工环境保护验收管理办法》的规定，建设项目主体工程完工后，其配套建设的环境保护设施必须与主体工程同时投入生产，同时验收。

1. 办理污染源排污口规范化申报登记

各项污染治理设施建成以后，办理污染源排污口规范化申报登记，领取排污口规范化登记回执和标志牌，其申报材料如下：污染源排污口规范化申报表、建设项目平面图、建设项目环境影响报告表、建设项目环境影响报告表的批复。
  2. 申请验收监测
各项污染治理设施的调试工作以及排污口规范化登记工作完成以后，申请监测部门对建设项目各排污口进行验收监测，其申报材料如下：委托监测申请书、排污口分布图、建设项目环境影响报表、建设项目环境影响报告表的批复、建设项目竣工环境保护“三同时”验收登记表、危险废物委托处理合同或协议书。
  3. 申请建设项目验收
申请建设项目验收必须具备以下条件：在批准的试运行期内，并达到项目设计能力75%以上；经环境监测部门测定，各排放口污染物浓度和总量符合要求；备齐符合验收要求的资料。

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广东省于2019年9月30日发布“粤环(2019)26号文”，文件内容为关于“停止核发广东省排污许可证”等有关事项通知，目前取消省排污许可证的核发，纳入需申请全国排污许可证的行业，在全国排污许可证管理信息平台网上填报信息申请核发排污许可证，对于尚未纳入需申请全国排污许可证的行业，具体解决措施等待国家生态和省进一步的文件指示。