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上海市所在地
TRzol(总 RNA 提取试剂)
¥561.6RNase Away 即用型强力 RNase 灭活剂
¥390RNAfixer 无液氮 RNA 样品储存液
¥702RNAlong RNA 长期保存液
¥132.6质粒小量快速提取试剂盒
¥405.6RNAsafe 高效 RNase 灭活剂
¥1060.8高纯度质粒小量快速提取试剂盒
¥592.8RNAclean RNA 清洁纯化试剂盒
¥936病毒基因组 DNA/RNA 快速提取试剂盒
¥1591.2PLANTaid 植物 RNA 助提剂
¥156TRzol LS(液体样本 RNA 提取试剂)
¥1076.40.1-1ml 凝固血基因组 DNA 提取试剂盒
¥1216.8Dnase I(Rnase free)
货号 | 规格 | 分类 |
XG-P3068 | 1000U | 核酸酶系列 |
该酶是将单链或双链 DNA 同等程度的随机分解,生成具有 5′-P 末端寡核苷酸的脱氧核糖核酸内切酶。由于RNase-free DNase I 中 Protease 已几乎被去除,从而提高了该酶在 pH 中性区域的稳定性。此外该酶中添加了
Rnase Inhibitor,用于抑制 RNA 样品中残留的 RNase 核酸酶,因此可以有效抑制 RNA 提取过程中 Rnase 酶对 RNA的降解。Stop Buffer 终止反应后,可通过一步加热失活DNase I 活性。
活性定义
在 50 μl 体系下,37℃ 10min 条件下消化 1 μg pBR322质粒 DNA 所需的酶量定义为 1 个活性单位。纯度
2 U 的本酶和 1 μg 的 16S, 23S rRNA 在 37℃、pH7.5 的条件下反应 1 小时,RNA 的电泳谱带不发生变化
应用:去除 RNA 样品中的 DNA 污染。
储存:-20°C 可保存 2 年。
操作方法(去除 RNA 中的基因组 DNA 污染)
1. 按以下组分配制反应体系
RNA 1~50 μg
10× RD Buffer 2 μl
Rnase Free DNase I (2 U/μl) 1 μl*
Rnase Free H2O Up to 20 μl
*若 RNA 样品中含有超过 5 μg 基因组 DNA 污染,请使用2 μl 该酶。
2. 37°C 孵育 15min 以消化去除基因组 DNA。
3. 孵育完毕后加入 2 μl 10× RD Stop Buffer,混合均匀室温放置 1min,并置于 75°C 10min 加热失活 DNase I。样品可直接用于下一步反转录等试验。
注意:
1)通常加热方法即可失活 DNase I。如需要去除残留的变性蛋白,可在 37°C 消化完毕后使用酚氯仿抽提并沉淀 RNA样品(不进行加热操作)。
2)10× RD Stop Buffer 中含有螯合剂用于去除二价阳离子,进行加热失活前,必须加入 2 μl 10× RD Stop Buffer 并混合均匀,再进行热失活,否则会导致 RNA 降解。
3)处理完毕的 RNA 样品进行一步反转录反应时,添加量需要<20%(如 20 μl 的反转录体系中加入量要<4 μl)
一、模板DNA:PCR反应需要模板DNA,如从细胞、组织、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反应的两个引物,分别与模板DNA的两端配对扩增所需的特定区域,引物也可以合成为TA克隆等过程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反应中需要四种dNTPs,包括脱氧腺苷酸(dATP)、脱氧胸苷酸(dCTP)、脱氧鸟苷酸(dGTP)、脱氧胞嘧啶酸(dTTP),用于细胞分裂、DNA合成 等生物学过程,用于PCR扩增的模板DNA链的延伸和扩增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反应需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,还有一些其他种类的聚合酶如PFU、Phusion等,用于扩增DNA链;
五、PCR buffer溶液:对PCR反应具有缓冲作用,调节反应pH,硫代硫酸氢盐SDS、小分子有机化合物如甲醛,可增强PCR反应特异性,从而提高反应效率;
六、酶切体系:PCR扩增往往涉及到重组、构建和测序等等实验步骤,常常需要进行酶切操作。
七、MARK:一种分子量标准,用来判别DNA片段大小的工具。
八、DNA纯化试剂盒:用于纯化PCR反应产物;
①Oligo dT
选择Oligo dT时,要求RNA必须有Poly A,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,对RNA样品的质量要求较高,不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。
②随机引物
适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,第链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5µg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5µg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片段、全长产物的降低。
③特异性引物
基因特异性引物(GSP)是某个基因序列的一部分,与模板互补的引物。该引物需要结合目标RNA的已知序列进行设计。由于引物和RNA序列特异性结合,每个目标RNA都需要一套新的基因特异性引物。因此,当分析多种目标时,则需要适用更多的RNA样本。而且不同引物退火温度本来就不相同,所以一般不推荐使用。如需要使用特异性引物,建议对退火温度进行优化。
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