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上海市所在地
TRzol(总 RNA 提取试剂)
¥561.6RNase Away 即用型强力 RNase 灭活剂
¥390RNAfixer 无液氮 RNA 样品储存液
¥702RNAlong RNA 长期保存液
¥132.6质粒小量快速提取试剂盒
¥405.6RNAsafe 高效 RNase 灭活剂
¥1060.8高纯度质粒小量快速提取试剂盒
¥592.8RNAclean RNA 清洁纯化试剂盒
¥936病毒基因组 DNA/RNA 快速提取试剂盒
¥1591.2PLANTaid 植物 RNA 助提剂
¥156TRzol LS(液体样本 RNA 提取试剂)
¥1076.40.1-1ml 凝固血基因组 DNA 提取试剂盒
¥1216.8Bst 3.0 DNA/RNA聚合酶(8U/ul)
货号 | 规格 | 分类 |
XG-P2949 | 1600U | 恒温扩增系列 |
XG-P2949 | 16KU | 恒温扩增系列 |
与Bst 2.0 DNA 聚合酶和Bst DNA 聚合酶大片段相比,Bst 3.0 DNA聚合酶具有更佳的等温扩增活性和更强的逆转录活性。无论以DNA还是RNA为模板,该酶都具有5’-3’的DNA聚合酶活性和强烈的链置换活性,但该酶5’-3’和3’-5’的外切酶活性缺失。
在以RNA为模板的LAMP实验中,可实现单酶系统反应。
该酶在60-65°C之间具有很好的反转录活性,可有效解决具有二级复杂结构的RNA模板的反转录,而Bst 2.0 DNA 聚合酶和Bst DNA 聚合酶大片段无此活性
单位定义:
一个活力单位即在 65°C 条件下,30 分钟内催化 10 nmoldNTP 的掺入反应成为酸不溶性物质所需的酶量。
储存:-20℃ 可保存 3 年。
典型的 LAMP 反应
1. 按以下组分配制 LAMP 反应液
Bst 3.0 DNA/RNA Polymerase (8 U/μl) 0.25~1 μl
10×Isothermo Buffer(Mg2+ free) 2.5 μl
100 mM Mg2+X μl
dNTP Mixture (10 mM each) 3.5 μl
模板 DNA/RNA 10ng~1 μg
*10X Primers 2.5 μl
ddH2O Up to 25 μl
*10X Primers:16 μM FIP/BIP, 2 μM F3/B3, 4-8 μM LpF/B each。
2. 65°C 30~60min; 85°C 5min 失活。
使用注意事项:
(1) Mg2+的使用浓度为 4~10 mM 浓度,Isothermo Buffer中没有 Mg2+,通常情况下,在 6-8mM Mg2+条件下可获得较好的 LAMP 结果。
(2) 有文献报道加入 Tte Uvrd 解旋酶可改善 LAMP 的效果。
(3) 使用无模板 DNA 作为对照检测扩增的特异性。
一、模板DNA:PCR反应需要模板DNA,如从细胞、组织、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反应的两个引物,分别与模板DNA的两端配对扩增所需的特定区域,引物也可以合成为TA克隆等过程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反应中需要四种dNTPs,包括脱氧腺苷酸(dATP)、脱氧胸苷酸(dCTP)、脱氧鸟苷酸(dGTP)、脱氧胞嘧啶酸(dTTP),用于细胞分裂、DNA合成 等生物学过程,用于PCR扩增的模板DNA链的延伸和扩增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反应需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,还有一些其他种类的聚合酶如PFU、Phusion等,用于扩增DNA链;
五、PCR buffer溶液:对PCR反应具有缓冲作用,调节反应pH,硫代硫酸氢盐SDS、小分子有机化合物如甲醛,可增强PCR反应特异性,从而提高反应效率;
六、酶切体系:PCR扩增往往涉及到重组、构建和测序等等实验步骤,常常需要进行酶切操作。
七、MARK:一种分子量标准,用来判别DNA片段大小的工具。
八、DNA纯化试剂盒:用于纯化PCR反应产物;
①Oligo dT
选择Oligo dT时,要求RNA必须有Poly A,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,对RNA样品的质量要求较高,不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。
②随机引物
适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5µg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5µg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片段、全长产物的降低。
③特异性引物
基因特异性引物(GSP)是某个基因序列的一部分,与模板互补的引物。该引物需要结合目标RNA的已知序列进行设计。由于引物和RNA序列特异性结合,每个目标RNA都需要一套新的基因特异性引物。因此,当分析多种目标时,则需要适用更多的RNA样本。而且不同引物退火温度本来就不相同,所以一般不推荐使用。如需要使用特异性引物,建议对退火温度进行优化。
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